L’isolation se fait généralement par l’intérieur : on ajoute alors, comme pour les maisons en ossature, de l’isolant, puis un pare-vapeur, une gaine technique, et un parement (placo, lambris…). Afin de gérer le tassement naturel des madriers, isolant et parement sont installés sur des morceaux de bois placés verticalement, ce qui leur permet de ne pas bouger même lorsque les madriers se mettent en place.

En toiture, l’isolation peut se faire :
– soit au-dessus des chevrons : la charpente sera alors visible dans la maison
– soit entre les chevrons : la charpente sera dissimulée